作者：林羿廷、廖吉彥、蔡錦慧、鄧汀欽*

摘要：

瓜類退綠黃化病毒 (Cucurbit chlorotic yellows virus, CCYV) 雲林縣二崙鄉分離株 (CCYV-Erlun)與宜蘭縣壯圍鄉分離株 (CCYV-Yilan)，以反轉錄聚合酶鏈式反應 (RT-PCR) 及 Rapid amplification of 5’ complementary DNA ends (5’ RACE) 等方法將其 RNA2 完全解序，各得全長為 8041 bp 之核苷酸序列；除 5’- 和 3’- 未轉譯端外，包括 p4.9 基因 (132 nt)、HSP70h 基因 (1671 nt)、p6 基因 (165 nt)、p59 基因 (1554 nt)、p9 基因 (240 nt)、CP 基因 (753 nt)、CPm 基因 (1425 nt) 及 p26 基因 (642 nt)。利用其中 CP 基因序列設計引子對進行 RT-PCR，可提高 CCYV 檢測的敏感性與準確性。藉由 RNA2 核苷酸序列比對及親緣分析，結果顯示於台灣發現之CCYV-Erlun (JN126045) 及CCYVYilan (JN126046) 都與日本、台灣、中國及蘇丹之 CCYV 相關核苷酸序列相同度達 99–100%。熵圖 (Entropy plot) 顯示兩個台灣分離株與日本原始分離株的 RNA2 核苷酸差異只有 12 nt (在總數8041 nt 中)，且主要都發生在 5’- 及 3’- 端未轉譯區。本研究發現目前全球各地發生之 CCYV 分離株彼此間基因同質性極高，親緣關係非常近，因此推論這些病毒都是同一來源。

關鍵字：瓜類退綠黃化病毒、反轉錄聚合酶鏈式反應、親緣分析、熵圖

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