台灣農業研究

受稻熱病菌誘導之水稻表現序列標幟 (EST) 的比較分析

作者:呂秀英*、邱怡嘉、陳政道、魏夢麗、呂椿棠

摘要:

稻熱病由真菌(Magnaporthe grisea (Hebert) Barr)所引起,是嚴重影響水稻(Oryza sativa L.)生產的世界性重要病害。表現序列標幟(expressed sequence tag, EST)是cDNA序列片段,直接研究EST可獲取基因表現訊息。為探討水稻不同品種於不同植株部位、不同發育時期感染稻熱病之不同功能基因的表現差異特性,本研究擷取NCBI的dbEST資料庫中不同水稻品種、植株部位及發育時期的受稻熱病菌誘導之水稻EST資料,共14個cDNA基因庫,就各基因庫分別進行EST的功能註解、分類和表現量統計,並藉由集群分析和對應分析檢測不同基因庫間之基因表現型式的差異性及表現基因的功能類別。結果顯示,野生稻受稻熱病菌侵染後,代謝、細胞生長和形態發生、次細胞定位和傳輸促進作用等相關功能的基因表現量,高於秈稻和稉稻;水稻葉片在不同生長階段中感染稻熱病,其表現出的能量和代謝功能之基因表現量以成熟期為最高,其次為分蘗期,苗期則最低;受稻熱病菌誘導的水稻EST序列若混合了不同品種及不同部位組織,與使用單一品種及固定部位組織在基因表現上有明顯差異。這些發現,可提供了解水稻對稻熱病防禦機制的參考。

關鍵字:水稻、稻熱病、表現序列標幟、功能註解及分類、基因表現量統計、集群分析、對應分析

下載:https://scholars.tari.gov.tw/bitstream/123456789/12043/1/56-4-2.pdf下載 Pdf 檔 PDF 連結

最後異動時間:2023-10-12 11:02:00
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