學術性

Comparative analyses of secreted proteins in plant pathogenic smut fungi and related basidiomycetes

自從擔子菌玉米黑穗病菌Ustilago maydis的基因組序列發表以來的十年中,感染了不同宿主的黑穗病物種的其他基因組變得可用。另外,確定了引起皮膚疾病的相關馬拉色菌屬物種的基因組和未知的感染植物的假酶菌物種的基因組。由於分泌的蛋白質是U. maydis中關鍵的毒力決定因素,因此我們在這裡比較12種擔子菌屬的分泌組,以獲取有關其組成和保存的信息。為此,使用InterPro掃描將分泌的蛋白質分為具有和沒有結構域的蛋白質。通過基於成對相似性構建簇來推斷蛋白質之間的同源性,然後在不同物種中評估簇的存在。我們特別檢測到假酶菌種的分泌組與植物感染性黑穗病之間的強烈對應關係。此外,鑑定出高比例的分泌蛋白成為基因家族的一部分,並以eff1家族的五個基因為例,提出了CRISPR-Cas9技術的進步,用於同時破壞 U. maydis中的多個基因。

發表刊物: 2018. Fungal Genetics and Biology. 112:21–30
最後異動時間:2020-02-21 10:37:00
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