作者：林玫珠、林羿廷、蔡錦慧、鄧汀欽*

摘要：

搜尋美國國家生物技術資訊中心 (National Center for Biotechnology Information; NCBI) GenBank 登錄之分蔥潛隱病毒種 (species Shallot latent virus; SLV) 分離株鞘蛋白基因核苷酸序列，進行親緣分析。本研究可將現有SLV 分為3 個分類群：第一群 (G1)、第二群 (G2)、第三群 (G3)。2015−2016 年間採集台灣的蔥屬植物樣品，進行酶聯抗體免疫分析 (enzyme-linked immunosorbent assay; ELISA) 及反轉錄-聚合酶鏈鎖反應 (reverse transcription-polymerase chain reaction; RT-PCR)，檢出10株SLV。將其鞘蛋白基因核苷酸序列定序，其中6 株SLV 鞘蛋白基因核苷酸長度為894 bp，屬於第一群 (G1)；另外4 株鞘蛋白基因核苷酸長度為885 bp，屬於第三群 (G3)。不同SLV 之病毒株鞘蛋白基因核苷酸序列的相同度大於74.3%，胺基酸序列相同度大於84.4%。根據所分類的各群病毒鞘蛋白基因核苷酸序列之差異，設計個別的專一性引子，進行RT-PCR，並配合巢式-聚合酶鏈鎖反應 (nested-polymerase chain reaction; nested-PCR)，可針對第一群 (G1) 病毒株增幅出187 bp 的條帶，第二群 (G2) 病毒株增幅出548 bp 的條帶，第三群 (G3) 病毒株增幅出540 bp 的條帶。將134 個經RTPCR測得SLV 的蔥科作物樣本進行上述的nested-PCR，其中52 個蒜球與25 個蒜苗的病毒株中，分別有51個與24 個病毒株為第一群；11 個韭菜的病毒株皆為第三群，其中有9 個另有檢出第一群者；34 個青蔥的SLV 中，有5 株為第一群，19 株為第三群、15 株均有檢出第一群與第三群者。由本研究所檢測的台灣蔥科作物中，並無發現第二群的SLV 存在。

關鍵字：分蔥潛隱病毒、蔥科作物、親緣分析、巢式-聚合酶鏈鎖反應

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