組織架構
本所組織編制置所長1人、副所長1人及主任秘書1人,其下設有作物、生物技術、農業化學、植物病理、應用動物、農業工程、農業經濟、作物種原、技術服務及農場管理等十個業務組,花卉研究中心及關西工作站二個附屬單位,秘書室、人事室、主計室、政風室等四個行政單位,並有嘉義農業試驗分所、鳳山熱帶園藝試驗分所。
第一層:所長
第二層:副所長
第三層:主任秘書
第四層: 秘書室、 主計室、 人事室、 政風室、 作物組、 生物技術組、 農業化學組、 植物病理組、 應用動物組、 農業工程組、 農業經濟組、 作物種原組、 技術服務組、 農場管理組、 關西工作站、 花卉研究中心、 嘉義農業試驗分所、 鳳山熱帶園藝試驗分所
現有人員239人,其中博士82人,碩士129人。
本所從事農藝與園藝作物之遺傳、育種、種原、生理、組織培養、生物科技、土壤肥料、植物營養、病蟲害防治、農業工程及氣象、農業經濟、農業推廣及農場經營管理等之科技研究,以改進各種作物之產量與品質。百餘年來本所對於台灣之糧食增產與農業經濟發展,具有卓越之貢獻。
未來,本所科技研發方向將著重:新品種選育及改進栽培管理技術;農業生物技術之研發與應用;作物種原蒐集保存與生物多樣性維護;園產品保鮮技術及農產品加工技術研究;病蟲害防檢疫新技術及非農藥防治方法研發;加強產學合作技術移轉及擴大國際農業交流,期以先進的農業科技帶動產業升級,再創我國農業發展之契機。