作者：林奕承、呂椿棠、魏夢麗、呂秀英*

摘要：

目前已知多白胺酸重複 (leucine-rich repeat, LRR) 為生物體抗病基因蛋白質序列上的特有序列，因此本研究針對水稻所有已定序之Xa基因，自NCBI (National Center for Biotechnology Information) 及KOME (Knowledge-based Oryza Molecular Biological Encyclopedia) 公共資料庫內擷取出它們已知的CDS (coding domain sequence) 與全長cDNA序列，將其轉譯的蛋白質序列利用Pfam蛋白質家族資料庫尋找出各LRR片段，發現僅在Xa1、Xa21及Xa26基因之表現蛋白質結構中發現LRR存在。進而利用生物資訊與統計方法，進行不同Xa基因蛋白質之LRR序列的分布及胺基酸組成之比較分析。結果顯示，Xa1之LRR在蛋白質序列中鬆散分布於NB-ARC (nucleotide- binding adaptor shared by APAF-1, R proteins, and CED-4) 區域序列之後，而Xa21及Xa26之LRR則密集分布在NB-ARC或P-kinase (protein-kinase) 區域序列之前。Xa1的蛋白質序列中靠近NB-ARC區域序列的前一、二個LRR似乎較遠離其他LRR，但Xa21和Xa26的蛋白質之LRR區域結構並未有如此現象。三個Xa基因表現蛋白質之LRR序列的胺基酸組成皆以親水性胺基酸為最多且其中以白胺酸 (leucine) 出現頻率最高，其次為不帶電荷之絲胺酸 (serine)。Xa1蛋白質之LRR在某些胺基酸的出現頻率相異於Xa21和Xa26。這些結果有助於了解不同Xa基因間表現蛋白質中特有LRR序列的結構變異情形。

關鍵字：水稻、Xa基因、白葉枯病、多白胺酸重複、胺基酸組成及屬性

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